Fatih Sultan Mehmed’in İstanbul’u fethinin ardından bir Osmanlı külliyesine dönüşmeye başlayan Ayasofya’nın kuzey tarafına medrese inşa edildi

II. Bayezid döneminde medrese üzerine bir kat ilave edilip yeni odalar açıldı

Tarihinde birçok kez onarım geçiren medresede en kapsamlı onarımlar 1839-1861 tarihleri arasında Sultan Abdülmecid döneminde yapıldı

Sultan Abdülaziz döneminde Ayasofya Camii’nin çevre düzenlemesi nedeniyle yıkılan medrese, 4 yıl sonra yeniden inşa edildi

İstanbul Belediyesi tarafından kimsesizler yurdu olarak kullanıldı

Ayasofya Camii müzeye dönüştürülürken yeniden yıkıldı

Kültür Bakanlığınca medresenin temel kazı ve araştırmaları yapıldı

Medresenin rekonstrüksiyonuna başlandı

Kültür ve Turizm Bakanlığı Vakıflar Genel Müdürlüğünce ihya edilen yapı 15 Nisan’da açıldı